加区纪委监委组织机构包括：内设职能部门、直属单位和派驻纪检监察组。内设职能部门具体为：办公室、党风政风监督室、信访室、案件监督管理室、第一监督检查室至第三监督检查室、第四审查调查室至第六审查调查室、案件审理室。
此外，设有加区纪委监委综合保障中心直属事业单位。设有加区纪委监委派驻纪检监察组。
内设机构及职责简介：
(一)办公室（组织部、宣传部、法规研究室、纪检监察干部监督室与其合署办公）。
1.负责机关日常运转；筹备组织重要会议、活动；组织起草有关文件文稿；督促检查有关工作部署的落实情况；负责机关事务管理、服务保障工作和安全保卫工作等。
2.负责全区纪检监察系统领导班子建设、干部队伍建设和组织建设的综合规划、政策研究和制度建设；负责编制管理、干部人事、人员档案、工资福利等工作；负责离退休干部工作等。
3.负责组织协调党风廉政建设和反腐败的宣传工作，组织开展对党员、公职人员的理想信念和宗旨教育、党风党纪和廉洁自律教育和有关网络信息工作等。
4.负责综合分析党风廉政建设和反腐败工作情况，开展政策理论及重大课题调查研究，起草重要文件文稿等。
5.负责监督检查纪检监察系统干部遵守和执行党的章程和其他党内法规，遵守和执行党的路线方针政策和决议、国家法律法规等方面的情况；受理对全区纪检监察干部涉嫌违反党纪、职务违法和职务犯罪等问题的举报，提出处置意见并负责问题线索初步核实及立案审查调查工作等。
(二)党风政风监督室。负责综合协调贯彻执行党的路线方针政策和决议、国家法律法规以及中央、省地重大决策部署等情况的监督检查；综合协调党的政治纪律和政治规矩执行、贯彻落实中央八项规定精神、纠正“四风”工作、整治群众身边和扶贫领域的腐败和作风问题；综合协调党内监督、问责等方面工作等。
(三)信访室。负责受理对党组织、党员和监察对象违反党纪、政纪行为的检举、控告，受理不服党纪政纪处分和其他处理的申诉，综合分析信访举报情况；处理群众来信、接待群众来访、接听举报电话、处理网络举报等。
(四)案件监督管理室。负责对监督检查、审查调查工作全过程进行监督管理，履行线索管理、组织协调、监督检查、督促办理、统计分析等职责；统一受理有关单位移交的相关问题线索以及下级纪检监察机关线索处置和案件查办报告；归口管理审查调查有关协调事项；对调查措施使用进行监督管理，监督检查纪检监察机关依纪依法安全办案情况等。
(五)第一至第三监督检查室。主要履行依纪依法监督的职责。监督检查联系单位（部门）领导班子及区管干部遵守和执行党的章程和其他党内法规，遵守和执行党的路线方针政策和决议、国家法律法规，推进全面从严治党，依法履职、秉公用权、廉洁从政从业以及道德操守等方面的情况；监督检查联系单位（部门）党委（党组）落实管党治党主体责任的情况，指导、检查、督促派驻机构落实纪检、监察责任，实施问责；向监察对象所在单位提出监察建议；综合分析研判问题线索，按程序提出处置意见或移交审查调查室；监督联系单位巡察整改落实情况等。
（六）第四至第六纪审查调查室。主要履行执纪审查和依法调查处置的职责。承办涉嫌严重违纪或者职务违法、职务犯罪问题线索的初步核实和立案审查调查，以及其他比较重要或者复杂案件的初步核实、审查调查，并提出处理建议；向监察对象所在单位提出监察建议；可以办理下一级监察机关管辖范围内的监察事项，必要时也可以办理所辖各级监察机关管辖范围内的监察事项等。
(七)案件审理室(申诉复查室)。负责审理区纪委、监委直接审查处理和党委（党组）、政府部门（单位）报批或备案的违犯党纪、职务违法和职务犯罪案件；负责牵头对区纪委、区监委直接调查涉嫌职务犯罪的案件移送检察机关；负责承办党员、监察对象以及县级党组织、政府（部门、单位）做出的党纪处分、政务处分决定不服的申诉案件等。
加区纪委监委综合保障中心职责简介：
1.承担为加格达奇区纪委监委提供综合保障和服务工作，为加格达奇区纪委监委履行纪检监察职能提供后勤及信息技术保障工作。
2.承担全区纪委监委系统信息化建设工作，承担信息网络的运行维护、安全保障等技术支撑工作。
3.负责全区党员干部反腐倡廉教育培训工作，负责制定警示教育工作规划、年度工作计划，开展警示教育业务指导。
4.负责全区纪检监察系统的电化教育，对全区纪检监察系统的电化教育工作进行调研、规划和指导；负责全区纪检监察系统教育培训等服务保障工作。
5.承担加格达奇区纪委监委重大活动、重要会议影音资料的录制和管理工作。
6.组织摄制党风廉政教育、警示教育等专题片，与相关媒体合作开设反腐倡廉专题节目；负责加格达奇区纪委监委多媒体宣传，编辑制作反腐倡廉专题教育教材，开展反腐倡廉网络宣传工作。
7.承担为区纪委监委审查调查提供保障和服务，负责区纪委监委办案区日常管理工作，为监督检查、审查调查提供保障服务；负责区纪委监委办案区全程同步录音录像监控设备、信息存储设备、办案指挥设备以及便携式办案设备等硬件设施的管理和使用。
8.配合办案指挥中心做好案件调度，负责协调医疗卫生、公安消防、供水供电等部门，协助办案区消防、安全保卫工作，协助办案科室开展办案谈话期间的安全，保密及应急事件处理，为执纪审查提供有力保障；受纪委监委指派担任安全员时，做好被留置人员的饮食、休息和安全等保障工作。
9.承担区纪委监委部署的信息采集任务，为区纪委监委履行纪检监察职能提供信息服务；为区纪委监委党的建设、组织建设和干部队伍建设提供保障和服务。
10.完成加格达奇区纪委监委交办的其他任务。